Un atome d'hydrogène lié de façon covalente à un atome peut-être attiré par un troisième atome. L'interaction est de type électrostatique et a lieu lorsque l'atome auquel est lié l'hydrogène est électronégatif. Le nuage électronique de l'hydrogène est attiré par cet atome et une charge partielle positive apparaît sur l'hydrogène. Cette charge positive est attirée par la charge partielle négative portée par le troisième atome. Il ne s'agit pas d'un liaison à proprement parler, c'est pourquoi on la désigne aussi par pont Hydrogène.