Génomique et Bioinformatique
Les méthodes automatisées utilisées en génomique permettent de déterminer la séquence entière des génomes.
Le séquençage des grands génomes se pratique dans centres spécialisés tel le génoscope .
Actuellement le séquençage de la plupart des virus connus, des bactéries les plus communes ou des bactéries pathogènes ainsi que celui de quelques animaux ou végétaux est terminée.
En ce qui concerne le génome de l'être humain sa séquence est déchiffrée à 99 %.
Néanmoins ce qu'il reste à déterminer pour le génome de celui-ci est le plus difficile car ce sont des régions sans marqueurs génétiques connus qui ne sont pas déchiffrées à ce jour
| Centres de séquençage et banques de données génétiques |
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| S.R.S. |
| European Bioinformatics Institute |
| European Molecular Biology Laboratory |
| N.C.B.I. |
| Sanger Institute |
| Logiciels de génomique de l' Institut Pasteur |
Exemple simple de recherche dans une banque de données à partir d'une protéine
1ère étape : Aller sur SRS , le serveur de recherche de l' Institut Européen de Bioinformatique, qui intègre de nombreuses banques de données en biologie moléculaire et analyse génomique.
2 ième étape : Sélectionner une banque de donnée, puis entrer le nom d'une protéine en anglais. exemple : "dopamin receptor".
Ensuite cliquez sur le bouton " search " vous devriez atteindre la séquence en acides aminés de la protéine et/ou la séquence des nucléotides du gène qui la code.
| Recherche et comparaison de séquences |
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| Génomes complets EBI |
| Berkeley Drosophila Genome Project |
| HIV Databases |
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