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Génomique et Bioinformatique
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Les méthodes automatisées utilisées en génomique permettent de déterminer la séquence entière des génomes. Le séquençage des grands génomes se pratique dans centres spécialisés tel le génoscope . Actuellement le séquençage de la plupart des virus connus, des bactéries les plus communes ou des bactéries pathogènes ainsi que celui de quelques animaux ou végétaux est terminée. En ce qui concerne le génome de l'être humain sa séquence est déchiffrée à 99 %. Néanmoins ce qu'il reste à déterminer pour le génome de celui-ci est le plus difficile car ce sont des régions sans marqueurs génétiques connus qui ne sont pas déchiffrées à ce jour
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| L' élaboration de programmes informatiques permettants le déchiffrage automatisé de séquences nucléotidiques, la mise des résultats dans des banques de données (dont la plupart sont accessibles pour tout public via internet), et l'élaboration de programmes de recherche d'analogies dans des séquences génétiques constitue le domaine de la bioinformatique. | |||||||||||
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Exemple simple de recherche dans une banque de données à partir d'une protéine 1ere étape : Aller sur S.R.S. le serveur de recherche de l'institut Européen de bioinformatique qui intègre de nombreuses banques de données en biologie moléculaire et analyse génomique.
2ieme étape : Sélectionner une banque de donnée par exemple la banque de donnée "swall" puis entrer le nom d'une protéine en anglais. exemple : "dopamin receptor". Ensuite cliquez sur le bouton " quick search " vous devriez atteindre la séquence en acides aminés de la protéine et/ou la séquence des nucléotides du gène qui la code. |
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| On peut aussi entrer une séquence d'acides aminés ou de nucléotides dans des programmes de recherche tels que Blast ou Fasta et ceux ci vont effectuer automatiquement des recherches d'analogies et des comparaisons de séquences avec les génomes de nombreux organismes. | |||||||||||
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